Sisältö
- DNA, geenit ja alleelit
- Alleelit ja fenotyypit
- Alleelitaajuuden määritelmä
- Laske alleelitaajuus
- Esimerkki laskelmista
- Genotyyppiset taajuudet Esimerkki
- Alleelitaajuudet Esimerkki
- Genotyyppisten ja alleelitaajuuksien tulkinta
Deoksiribonukleiinihappo, tunnetuimmin nimellä DNA, on molekyyli, jota löytyy valtaosasta eläviä organismeja ja viruksia, joita löytyy maapallolta. DNA kantaa geneettinen tietotai koodi, joka tekee kaikesta mitä se on.
DNA eroaa lajeittain ja lajeittain yksilöiden välillä. Esimerkiksi ihmisissä DNA määrittelee ihmisen silmien, ihon, hiusten värin, korkeuden ja kaikki muut ominaisuudet, jotka tekevät jokaisesta ihmisen ainutlaatuisen.
DNA, geenit ja alleelit
DNA koostuu eri geeneistä. Geenit kuljettavat kunkin vanhemman perimätietoja.
Jokainen geeni löytyy kromosomin tietystä lokuksesta. Geenillä voi olla useita muunnelmia koostuu erilaisista alleelisekvensseistä.
Alleelit ja fenotyypit
Alleelit määrittävät näkyvät yksilölliset ominaisuudet, joita kutsutaan fenotyyppejä. Esimerkiksi sininen, vihreä, ruskea ja pähkinänruskea ovat kaikki erilaisia ihmissilmän fenotyyppejä.
Kun tarkastellaan yhtä monista silmien värin geeneistä ihmisryhmässä, sinisillä silmillä olisi erilainen alleelisarja kuin niillä, joilla on ruskeat, pähkinänruskeat ja vihreät silmät.
Alleelitaajuuden määritelmä
Alleelitaajuus on yksilöiden lukumäärä populaatiossa, joilla on a spesifinen alleelityyppi. Ihmiset käyttävät alleelitaajuuslaskelmaa auttamaan ymmärtämään fenotyypin esiintymistiheyttä populaatiossa.
Nämä tiedot antavat käsityksen populaation geneettisestä monimuotoisuudesta. Kun alleelitaajuudet kirjataan ajan myötä, geneettisen monimuotoisuuden muutokset voidaan havaita.
Laske alleelitaajuus
Alleelitaajuuden laskemiseksi populaation yksilöiden kokonaismäärä on laskettava. Sitten lasketaan niiden yksilöiden lukumäärä, joilla kullakin on kyseinen fenotyyppi.
Luo summa kaikista kokonaismääristä. Alleelitaajuuksien löytämiseksi jaetaan kuinka monta kertaa alleeli lasketaan populaatiossa kyseisessä geenissä olevien alleelikopioiden kokonaismäärällä.
Esimerkki laskelmista
Oletetaan esimerkiksi, että populaatiossa on 100 yksilöä ja kahden tyyppisiä alleeleja, B sinisille silmille ja G vihreille silmille. Jokaisella henkilöllä on kaksi kopiota jokaisesta alleelista, joten kerrota kaksi 100: lla, jotta saadaan 200 alleelikopiota populaatiossa.
Todellisessa elämässä on monia geenejä, jotka koodaavat ihmisen silmien väriä, mutta tässä skenaariossa on vain kolme erilaista alleeliyhdistelmää tässä geenivarannossa; BB, BG ja GG. Seuraavaksi lasketaan väestön lukumäärä jokaisella alleelityypillä.
Genotyyppiset taajuudet Esimerkki
Tässä esimerkissä on 50 ihmistä, joilla on BB, 23 henkilöä, joilla on BG ja 27 henkilöä, joilla on GG. Genotyyppisten taajuuksien löytämiseksi jakaa vain tietyn fenotyypin ihmisten lukumäärä ihmisten kokonaismäärällä.
Tässä tapauksessa 50 BB jaettuna 100: lla tarkoittaa, että 50 prosentilla väestöstä on BB-genotyyppi. BG: n geenitaajuus olisi 23 prosenttia ja 27 prosentilla geenivarannon ihmisistä olisi GG-geenityyppi.
Alleelitaajuudet Esimerkki
Vaikka genotyyppiset taajuudet tarkastelevat geenien ilmentymistä, alleelitaajuudet tarkastelevat kuinka monta kertaa erityinen alleeli esiintyy populaatiossa. B: n alleelitaajuuden löytämiseksi tässä esimerkissä kerrotaan 50 kahdella, koska BB-genotyypissä on kaksi B: tä.
Lisää sitten ihmiset, joilla on BG-genotyyppi, koska myös heillä kaikilla on B-alleeli, jolloin saadaan yhteensä 123 B-alleelia. Jaa lopuksi 123 200: lla Jokaisella populaation henkilöllä on kaksi alleelia, jolloin alleelitaajuus oli 0,615 tai 61,5 prosenttia.
Seuraavaksi tee sama G-alleelille. Kertomalla 27 ihmistä GG-alleeleilla kahdella ja lisäämällä 23 ihmistä, joilla on myös G-alleeli, jakamalla tämä lukumäärä, 77, 200: lla, saadaan 0,385 tai 38,5 prosenttia.
Tarkista virheiden varalta varmistamalla, että kaikki alleelitaajuudet lisäävät yhden tai 100 prosenttia. Tässä 61,5 lisättynä 38,5: een on yhtä suuri kuin 100.
Genotyyppisten ja alleelitaajuuksien tulkinta
Nämä laskelmat ovat antaneet tietoa siitä, kuinka monella ihmisellä on siniset fenotyyppisilmät ja kuinka monella on vihreät fenotyyppisilmät tässä 100 ihmisen populaatiossa. Alleelitaajuuksien perusteella on selvää, että B-alleeli on hallitsevampi populaatiossa.
Jatkamalla tätä tutkimusta tulevissa sukupolvissa tulee ilmeiseksi, jos alleelitaajuuksissa tapahtuu muutoksia ajan myötä, ja tarjoavatko jonkinlaisen kuvan väestön kehitys.