Sisältö
Kuvittele, että sinulla on kaksi ohutta säiettä, molemmat noin 3/4 jalkaa pitkiä, joita pitävät vettä hylkivästä materiaalista tehdyt katkelmat yhden langan muodostamiseksi. Kuvittele nyt, että sovitat tämän langan halkaisijaltaan muutaman mikrometrin mittaisella vesitäytetyllä astiassa. Nämä ovat olosuhteet, joihin ihmisen DNA kohtaa solun ytimen. DNA: n kemiallinen meikki, yhdessä proteiinien toiminnan kanssa, kiertää DNA: t kaksi ulkoreunaa spiraalimuotoon tai kierteeseen, jotka auttavat DNA: ta sopeutumaan pieneen ytimeen.
Koko
Solun ytimessä DNA on tiukasti käämitty, säiemainen molekyyli. Ydin- ja DNA-molekyylit vaihtelevat kooltaan olentojen ja solutyyppien välillä. Joka tapauksessa yksi tosiasia pysyy yhdenmukaisena: venytettynä tasaiseksi, solu-DNA olisi eksponentiaalisesti pidempi kuin ytimensä halkaisija. Avaruusrajoitukset vaativat kiertämistä DNA: n tiivistämiseksi ja kemia selittää, miten kiertyminen tapahtuu.
Kemia
DNA on suuri molekyyli, joka on rakennettu pienemmistä molekyyleistä, jotka koostuvat kolmesta eri kemiallisesta aineosasta: sokerista, fosfaatista ja typpipohjaisista emäksistä. Sokeri ja fosfaatti sijaitsevat DNA-molekyylin ulkoreunoilla siten, että emäkset on järjestetty niiden väliin kuin tikkaat. Koska solujemme nesteet ovat vesipohjaisia, tämä rakenne on järkevä: sokeri ja fosfaatti ovat molemmat hydrofiilisiä tai vettä rakastavia, kun taas emäkset ovat hydrofobisia tai vettä pelkääviä.
Rakenne
••• Hemera Technologies / AbleStock.com / Getty ImagesNyt kuvaa tikkaiden sijasta kierretty köysi. Kierteet tuovat köyden säikeet lähelle toisiaan, jättäen niille vähän tilaa. DNA-molekyyli kääntyy samalla tavalla kutistaakseen sisäpuolelta hydrofobisten emästen välisiä tiloja. Kierremuoto estää vettä virtaamasta niiden välillä ja jättää samalla tilaa kunkin kemiallisen ainesosan atomien sovittamiseksi päällekkäin tai häiritsemättä.
pinoaminen
Emästen hydrofobinen reaktio ei ole ainoa kemiallinen tapahtuma, joka vaikuttaa DNA: n kiertymiseen.Typpipitoiset emäkset, jotka istuvat toisistaan toisistaan DNA: issa, kahta juostetta vetävät toisiaan, mutta myös toinen houkutteleva voima, nimeltään pinoamisvoima, on leikissä. Pinoamisvoima houkuttelee tukikohtia toistensa ylä- tai alapuolella samassa säikeessä. Duke-yliopiston tutkijat ovat oppineet syntetisoimalla vain yhdestä emäksestä koostuvia DNA-molekyylejä, että kukin emäs käyttää erilaista pinovoimaa, mikä osaltaan edistää DNA: n spiraalin muotoa.
proteiinit
Joissakin tapauksissa proteiinit voivat aiheuttaa DNA-osien kelaamisen vieläkin tiiviimmin muodostaen ns. Superkelat. Esimerkiksi entsyymit, jotka auttavat DNA: n replikaatiossa, luovat lisäkierroksia kuljettaessaan DNA-juostetta. Myös 13S-kondensiini-niminen proteiini näyttää herättävän superkäämiä DNA: ssa juuri ennen solunjakautumista, Kalifornian yliopiston, Berkeley, vuoden 1999 tutkimus paljasti. Tutkijat jatkavat näiden proteiinien tutkimusta toivoen ymmärtävänsä edelleen DNA-kaksoiskierukan kierteitä.