Sisältö
- TL; DR (liian pitkä; ei lukenut)
- Integroitu tutkimusala
- Evolutionaariset suhteet
- Liittyvien geenien vertailu
- Vinkkien löytäminen
Vertaileva biokemia voi olla epämääräinen käsite, jolla on useita merkityksiä, vaikka se voi paljastaa kiehtovia vuorovaikutuksia organismien ja niiden biologioiden välillä. Ainakin tutkijat kutsuvat sitä tieteidenväliseksi tieteenalaksi, jolla pyritään saamaan käsitys vastaamattomiin kysymyksiin etsimällä yhteyksiä näennäisesti liittymättömien aiheiden välillä. Käytännössä se ymmärretään yleisimmin joko tutkimiseksi organismien välisiä evoluutiosuhteita ja kuinka nämä suhteet valaisevat syvempiä kysymyksiä biologisen elämän muotojen toiminnasta.
TL; DR (liian pitkä; ei lukenut)
Tieteidenvälisen tutkimuksen, vertailevan biokemian, tavoitteena on kuroa kuilu tieteen eri alojen välillä. Yleisimmin se viittaa tutkimukseen siitä, kuinka elämän muodot elävät ja kuinka niiden muodostamat kappaleet toimivat solutasolle asti.
Integroitu tutkimusala
Kalifornian yliopistossa Berkeleyssä on jatko-ohjelma nimeltään Vertaileva biokemia. Sen tiedekunnan jäsenet tulevat eri tieteenaloilta, mukaan lukien molekyylibiologia, solubiologia, kemia, kasvibiologia, ravitsemus ja kansanterveys. Tämä monimuotoisuus osoittaa vertailevan biokemian laajan soveltamisalan oppiaineena. Se korostaa myös näille tutkimusaloille vallitsevia yhteisiä piirteitä, osoittaen, että näennäisesti erilaiset kentät voivat tosiasiallisesti antaa tietoa yksittäisten alojen ongelmien ratkaisemisesta. Lehtiä on myös vertailevan biokemian nimellä, ja julkaisujensa laajuus korostaa edelleen tieteidenvälisen tutkimuksen aiheita.
Evolutionaariset suhteet
Vertailevan biokemian yleinen määritelmä on organismien välisten evoluutiosuhteiden tutkimus. Kaikilla elävillä organismeilla on yhteinen geneettinen koodi DNA: n muodossa, joka tarjoaa tietoa proteiinikoneiden valmistamiseksi, jotka tekevät solujen päivittäistä työtä. Vertailevassa biokemiassa tutkitaan proteiinikoneita ja entsyymejä, mutta DNA-sekvenssit koodaavat molempia. Vertailemalla näiden geenien yhtäläisyyksiä ja eroja, tutkijat voivat koota yhteen organismien evoluutiosuhteet. Tämän tarkoituksena on ymmärtää paremmin elämän historiaa, mutta myös löytää eläintutkimustapoja, jotka saattavat valaista ihmisen sairauksia.
Liittyvien geenien vertailu
Eri eliölajit voivat sisältää samoja geenejä, mutta sekvensseillä on vähän tai hyvin erilaisia. Nämä geenit voivat tehdä samanlaisia asioita jokaisessa organismissa tai ne voivat tehdä hyvin erilaisia asioita. Tämä tapahtuu niiden DNA-sekvenssien erojen takia, jotka ilmenevät samanlaisina proteiineina, joilla on hieman erilaiset kolmiulotteiset muodot ja siten erilaiset toiminnot. Kahden lajin samanlaisten geenien tutkimuksen etuna on, että yhden lajin geenin rakenne ja toiminta antaa usein käsityksen sen roolista muissa lajeissa.
Vinkkien löytäminen
Aivan kuten yksi organismin geeni voi auttaa tutkijaa ymmärtämään samanlaisen geenin toisessa organismissa, oivalluksia voidaan saada vertailevan biokemian avulla monien proteiinien vuorovaikutustasosta. Proteiinit muodostavat usein komplekseja tai proteiiniklusteria kumppaniproteiinien kanssa työtä tekeessään. Sen oppiminen, joka on vuorovaikutuksessa kenen kanssa yhdessä lajissa solun toiminnan suorittamiseksi, auttaa tutkijaa arvaamaan toisen lajin tietyn geenin vuorovaikutuksessa olevat kumppanit. Tämä lähestymistapa auttaa tutkijoita tekemään koulutettuja arvauksia siitä, mitä tuntemattomia proteiineja on vielä tunnistettava muiden lajien kumppaneiksi.