Sisältö
- Etu: Herkkyys
- Etu: erityisyys
- Haitta: altis virheellisille tai subjektiivisille tuloksille
- Haitta: korkeat kustannukset ja tekninen kysyntä
Western blot, analyyttinen tekniikka, jota käytetään määrittämään tietty proteiini tietyssä näytteessä, käyttää entsyymin tai fluoresenssileimatun primaarivasta-aineen kykyä sitoutua sen spesifiseen antigeeniin. Se on kolmivaiheinen prosessi, joka alkaa geelielektroforeesilla, jota seuraa kalvon blottaus ja koettaminen vasta-aineilla. Proteiinin havaitseminen voi olla suoraa tai epäsuoraa, jälkimmäisen kanssa käyttämällä primaarista vastaan suunnattua leimattua sekundaarista vasta-ainetta. Vaikka Western blot hyväksytään rutiiniproteiinianalyysimenetelmäksi, sillä on rajoituksia ja hyötyjä.
Etu: Herkkyys
Yksi suurimmista Western blot -arviointia tukevista argumenteista on sen herkkyys. Koska tekniikka kykenee havaitsemaan näytteessä vain 0,1 nanogrammaa proteiinia, tekniikka voi teoreettisesti toimia tehokkaana varhaisdiagnostiikan työkaluna, joka havaitsee potilaan näytteessä pienimmänkin immunogeenisen vasteen viruksesta tai bakteereista. Epäsuora Western-blotti perustuu edelleen tähän herkkyyteen sekundaarisen vasta-aineen kyvystä vahvistaa kuvantamisjärjestelmän havaitseman signaalin voimakkuutta. Suurempi herkkyys tarkoittaa, että testaamiseen tarvitaan vähemmän vasta-aineita, mikä vähentää laboratoriokustannuksia merkittävästi.
Etu: erityisyys
Western blot -menetelmä johtuu sen spesifisyydestä kahdelle suurelle vaikuttavalle tekijälle. Ensin geelielektroforeesi lajittelee näytteen erikokoisiksi, varauksellisiksi ja konformaatioisiksi proteiineiksi. Tämä prosessi itsessään on valtava askel kohti havaitsemista, koska geeliin muodostetut nauhat antavat jo johtolankoja kiinnostavan proteiinin tai polypeptidin koon suhteen. Vasta-aine-antigeeni-vuorovaikutuksen spesifisyys toimii toisena suurena tekijänä. Koska spesifisillä vasta-aineilla on affiniteetti spesifisiin proteiineihin, prosessi voi selektiivisesti havaita kohdeproteiinin jopa 300 000 eri proteiinin seoksessa.
Haitta: altis virheellisille tai subjektiivisille tuloksille
Herkkyydestään ja spesifisyydestään huolimatta Western-blotti voi silti antaa virheellisiä tuloksia. Väärä positiivinen tulos, kun vasta-aine reagoi ei-tarkoitetun proteiinin kanssa, mikä tapahtuu usein, kun potilaalla, jota testataan HIV: lle, sattuu olemaan tuberkuloosi tai useita lois-infektioita. Vääränegatiivinen, toisaalta, voi johtaa helposti, jos suuremmille proteiineille ei anneta riittävästi aikaa siirtyä kunnolla kalvoon. Virheellinen blottaus ja käsittely tuottavat usein vinoja, haalistuneita tai jopa useita juovia, jolloin testitulokset riippuvat teknikon tulkinnasta.
Haitta: korkeat kustannukset ja tekninen kysyntä
Western blot -kustannus on yhdistelmä merkityistä vasta-aineista, ammattitaitoisista analyytikoista ja laboratoriolaitteista aiheutuvista suurista yksittäisistä menoista. Hieno prosessi, Western-blottaus, vaatii tarkkuutta jokaisessa vaiheessa näytteen ainesosien tunnistamiseksi oikein. Pieni virhe reagenssipitoisuudessa tai inkubaatiokaudella voi olla tuhoisa koko prosessille. Lopuksi havaitsemiseksi ja kuvantamiseksi tarvittavat laitteet - kemiluminesenssi-, fluoresoivat, radioaktiiviset tai laserilmaisujärjestelmät - voivat olla liian kalliita keskimääräiselle mikrobiologiayksikölle.