Sisältö
- Positiivinen tai negatiivinen
- Bakteerien muodostaminen
- Kuutiot, klusterit ja muut linkit
- Bakteerin tunnistaminen
Aloita tuntemattomien bakteerien tunnistaminen seuraamalla niiden fysikaalisia ominaisuuksia, kuten soluseinämää, muotoa ja sidoksia. Käytä tavanomaisia laboratoriomenetelmiä, kuten solujen värjäystä, viljelyä ja DNA-sekvensointia kaventaaksesi tunnistasi entisestään. Bakteerit ryhmitellään yleensä lajeihin niiden fysikaalisten ja aineenvaihdunnan ominaispiirteiden eikä geneettisten suhteidensa perusteella toisiinsa.
Positiivinen tai negatiivinen
Eubakteerit ovat ns. Tosi bakteereja.Ne eroavat arhaeasta tai arkebakteereista, jotka muodostavat erillisen valtakunnan. Eubakteerit ovat prokaryootteja, mikä tarkoittaa, että heistä puuttuu ydinmembraani. Useimmissa on solukalvoja ja soluseinämiä. Bakteereita, joilla on paksut soluseinät, kutsutaan gram-positiivisiksi, koska ne ovat kuolleet Gram-värikartan nimisen testin aikana. Gram-tahra on ensimmäinen testi, jota käytetään bakteerien luokittelussa. Bakteerit, joilla on ohuet tai puuttuvat soluseinät, ovat gramnegatiivisia, koska ne eivät pidä Gram-väriainetta.
Bakteerien muodostaminen
Pallomaisia bakteereja kutsutaan cockeiksi, suoria sauvoja muodostavia bakteereja kutsutaan bacilaisiksi ja välimuodossa olevia bakteereja coccobacilliiksi. Ne voivat kaikki olla gram-negatiivisia tai gram-positiivisia. Jäykät, kierremaiset bakteerit tunnetaan nimellä spirilla ja ovat vain gram-negatiivisia. Joustavia, itsenäisesti liikkuvia, spiraalimuotoisia bakteereja kutsutaan spiroketeiksi ja ne ovat gramneutraaleja. Lopuksi jäykkiä, pilkkumaisia sauvoja kutsutaan vibroiksi ja ne ovat gramnegatiivisia. Muutamilla vähän tunnetuilla ja huonosti ymmärretyillä bakteereilla on erilaiset muodot, kuten tähdenmuotoisilla stella- ja kirvesmuotoisilla labrilla. Bakteeriryhmiä on myös kaksi. Riketsiat ovat samanlaisia kuin virukset, niiden muoto on monenlainen, ne ovat gram-negatiivisia ja voivat säilyä vain muiden solujen sisällä. Mykoplasmasta, joka on samanlainen kuin sienet, puuttuvat soluseinät ja siihen sisältyy monia lajaspesifisiä, keuhkokuumeen aiheuttavia keuhkopatogeenejä.
Kuutiot, klusterit ja muut linkit
Cocci ja bacilli luokitellaan edelleen niiden solujen perusteella, jotka ne muodostavat solunjakautumisen jälkeen. Diplococci ja diplobacilli tarttuvat toisiinsa pareittain. Streptokokit ja streptobacillit muodostavat ketjut. Tetrad-kokit pysyvät neljän bakteerin neliöissä. Sarcinae-kokit muodostavat kahdeksan bakteerikuutiota ja stafylokokit muodostavat klusterit.
Bakteerin tunnistaminen
Jos sinulla on tuntemattomia bakteereja ja haluat tunnistaa ne, suoritat yleensä grammavärjäyksen ja tarkkailet sitten siirtokunnan ulkoasua ja yksittäisiä piirteitä. Tässä vaiheessa voit sanoa, että sinulla on esimerkiksi gram-negatiivinen, aerobinen streptobacilli. Voit sitten verrata näytettä erilaisiin tunnettuihin bakteereihin asettamalla sen erilaisiin viljelyalustoihin, jotka edistävät joidenkin lajien kasvua ja estävät toisia, tai testaamalla näytteestä erilaisia tunnettuja bakteeriperäisiä sivutuotteita. Viimeisenä keinona DNA-sekvensointi voi määrittää, onko sinulla tunnettuja tai tuntemattomia bakteereja tai kantoja, mikäli vertaat sitä lajiin tai kantaan, jonka genomi on jo sekvensoitu.