Sisältö
Kaksijuosteisen DNA: n rakenne on universaali kaikissa elävissä soluissa, mutta eroja esiintyy menetelmissä genomisen DNA: n erottamiseksi eläin- ja kasvisoluista. Vaikka genomi-DNA elää solujen ytimessä, uutetun DNA: n määrä ja puhtaus riippuvat solun tyypistä ja koosta. Esimerkiksi tietyt solut sisältävät enemmän DNA: ta ja epäpuhtauksia kuin toiset. Lue lisätietoja DNA: n erotuseroista.
Yleinen DNA-uutto
Jos käsittelet kasvi- ja eläinsoluja saippua-aineella, se hajottaa solujen ja ydinkalvojen lipidejä. Sitten DNA-seos erottuu solukalvoista ja proteiineista. Seuraavaksi voit käyttää alkoholia DNA: n saostamiseen liuoksessa. Näytteen määrästä riippuen DNA voi olla näkyvissä paljain silmin. Muista kuitenkin, että tämä yksinkertainen menetelmä ei välttämättä tuottaa korkealaatuista DNA: ta.
Kasvi- ja eläinsolut
Kasvisolut eroavat eläinsoluista jäykän soluseinämänsä ja organellinsa, kuten kloroplastin, vuoksi. Ne sisältävät myös proteiineja ja entsyymejä, joilla on merkitystä fotosynteesissä. Joillakin kasvisoluilla on polyploidia, mikä tarkoittaa, että heillä on useampi kuin yksi kopio jokaisesta kromosomista solua kohti. Lisäksi kasveissa tapahtuvat soluprosessit, kuten fotosynteesi, tuottavat joukon sekundaarisia metaboliitteja. Eläinsoluilla ei ole soluseinää, mutta ne tarvitsevat silti kemikaaleja, kuten natriumdodekyylisulfaattia (SDS), solun kalvon hajottamiseksi genomisen DNA: n vapauttamiseksi.
Kasvien DNA: n uutto
Kasvin perimän DNA: ta on vaikeampaa erottaa kasvin soluseinämän vuoksi. Voit poistaa sen homogenoimalla tai lisäämällä sellulaasia hajottamaan soluseinän muodostavan selluloosan. Lisäksi kasvisolussa läsnä olevat metaboliitit voivat häiritä genomisen DNA: n uuttamista saastuttamalla DNA-näyte saostusprosessin aikana.
Eläinten DNA: n uutto
Perifeerisen veren leukosyytit ovat eläimen perimän DNA: n päälähde, mutta näytteenotto on vaikeaa, koska veren on oltava peräisin suoraan eläimestä. Veri sisältää joukon yhdisteitä, kuten proteiineja, lipidejä, valkosoluja, punasoluja, verihiutaleita ja plasmaa, jotka voivat saastuttaa DNA-näytteen. Verinäytteistä uutetun eläin-DNA: n ensisijainen kontaminentti on kuitenkin hem, joka on hemoglobiinin ei-proteiinikomponentti.
DNA-erot
Ero kasvien ja eläinten DNA: n välillä on kierteessä olevien emäsjärjestyksessä. Kasvisoluista löytyviä yhdisteitä puuttuu eläinsoluista, ja DNA-emässekvenssit heijastavat tätä. Myös genomisen kasvin DNA on usein suurempi kuin eläimen DNA. Nämä erot vaikuttavat myös uuttamismenetelmiin, saantoon ja DNA: n puhtauteen.