Sisältö
Sairauden etenemiskäyrän (AUDPC) alapuolella oleva alue on kvantitatiivinen mittaus taudin intensiteetistä ajan myötä. Sitä käytetään kasvien patologiassa osoittamaan ja vertaamaan kasvilajikkeiden tautienkestokykyä. Trapezoidimenetelmä on yleisin tapa laskea AUDPC. Se suoritetaan käyttämällä Campbellin ja Maddenin vuonna 1990 kehittämää kaavaa tai piirtämällä kuvaaja infektion prosentuaalisuudesta ajan suhteen ja summaamalla trapetsoidit aikavälien välillä.
Mittaa taudin eteneminen
Tutkimussäännöt ja -ohjeet tutkittavan tietyn sairauden ja sadon mittaamiseen. Kasvinäytteen vaadittava koko vaihtelee sadon ja taudin mukaan. Esimerkiksi mukuloiden myöhään leviämisen tutkiminen vaatii vähintään 40 kasvinäytettä.
Istuta sopiva määrä kasveja, joita tutkimus vaatii.
Tarkkaile tarkkaan taudin merkkejä. Tutki, milloin oireita odotetaan tapahtuvan, jotta olet valmis. Esimerkiksi myöhään leviämisen merkkejä ilmenee noin 30–40 päivää istutuksen jälkeen ja 10 päivää viimeisen sienitautien levityksen jälkeen.
Arvioi visuaalisesti tartunnan saaneiden lehtien pinta-ala näytteessä heti kun huomaat taudin.
Merkitse tartunnan saaneiden lehtien pinta-ala prosentteina säännöllisin väliajoin. Tutkijat ottavat lukeman myöhään kuolleesta seitsemästä päivästä, jos sairaus etenee odotettua nopeammin. Lukemat otetaan joka 14. päivä, kun taudin eteneminen on hitaampaa.
Lopeta infektion mittausten kirjaaminen, kun tartunnan prosenttiosuus lakkaa kasvamasta ja taudin etenemistaso.
Laske AUDPC yhtälöstä
Lisää kaksi ensimmäistä tallennettua infektioprosenttia.
Jaa lisäystulos kahdella saadaksesi kahden lukeman keskiarvo tai keskiarvo.
Kerro keskiarvo tai keskiarvo aikavälillä, joka on päivien lukumäärä ensimmäisestä käsittelystä toiseen. Jos otit ensimmäisen käsittelyn päivänä 20 ja toisen käsittelyn esimerkiksi päivänä 27, niin päivien lukumäärä tai aikaväli on seitsemän päivää.
Tallenna tulos prosenttiyksikköinä päivinä. Arvo on puolisuunnikkaan pinta-ala.
Toista vaiheet yhdestä neljään toisen ja kolmannen tartuntalukeman perusteella. Niiden tulos on toisen trapetsoidin pinta-ala. Toista vaiheet yhdestä neljään, kunnes olet laskenut trapetsoidut alueet kaikille lukemille.
Lisää kaikki trapetsoidit löytääksesi AUDPC. Alemmat AUDPC-arvot edustavat hitaampaa taudin etenemistä ja parempaa vastustuskykyä taudille. Korkeammat AUDPC-arvot edustavat nopeampaa sairauden etenemistä ja suurempaa alttiutta sairaudelle.